Desa Binusan adalah bagian integral dari Kecamatan Nunukan Kabupaten Nunukan Provinsi Kalimantan Utara dengan luas wilayah 95,540 Km² atau 9.895.85 Ha.
Desa Binusan berdiri tahun 2003 yang di sahkan dalam Peraturan Daerah Kabupaten Nunukan Nomor 10 Tahun 2003
Tentang Pembentukan Desa Binusan, Desa Liang Bunyu, Desa Sanur, dan Desa Makmur dalam Wilayah Kabupaten Nunukan (lembaran daerah Kabupaten Nunukan Tahun 2003 Nomor 10 Seri D Nomor 10);
Desa Binusan memiliki 15 Rukun Tetangga (RT) dengan jumlah penduduk 4.706 jiwa. Jumlah KK 1.254 . Jumlah penduduk Laki-laki = 2.546 Jiwa dan Perempuan = 2.180 jiwa.
Desa Binusan berada diketinggian dari permukaan laut kurang lebih 300 meter dengan tofografi dataran rendah dengan batas-batas wilayah berikut :
* Sebelah Utara berbatasan dengan Kel. Nunukan Barat
* Sebelah Selatan berbatasan dengan Laut Sulawesi
* Sebelah Timur berbatasan dengan Kel. Nunukan Selatan
* Sebelah Barat berbatasan dengan Selat St. Lucia